موزه علوم طبیعی بهاباد يزد در سال 1380 افتتاح گردید این موزه در سه بخش جانوران . گیاهان . سنگها وفسیلها فعال می باشد. بخش جانوران شامل جانوران بومی منطقه و آبزیان خلیج فارس ودریای عمان می باشد . لازم به ذکر است این موزه در بخش آبزیان مقام اول را در بین موزه های استان یزد دارد.